Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav12-2A0N8N6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms