Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms