Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4921501E09RikA0A0R4J054 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms