Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms