Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv30A0A0B4J1P1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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