Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms