Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B694

Trav14-2, T cell receptor alpha variable 14-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14-2A0A075B694 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav14-2A0A075B694 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trav14-2A0A075B694 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav14-2A0A075B694 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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