Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Exoc5-207ENSMUST00000162175 12699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Col5a3Q9JLI2 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Lpar2-201ENSMUST00000034325 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Mapk9-203ENSMUST00000102778 4447 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Abca17-201ENSMUST00000039324 5202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Col5a3Q9JLI2 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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