Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm37108-201ENSMUST00000194605 626 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Kcne3-207ENSMUST00000208260 929 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Cd37-208ENSMUST00000210372 960 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm5614-201ENSMUST00000091097 318 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr1491-202ENSMUST00000214007 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr1491-203ENSMUST00000215493 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr1491-205ENSMUST00000216377 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Mtbp-204ENSMUST00000169667 2570 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm38251-201ENSMUST00000192968 2575 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Magea5-201ENSMUST00000069556 1360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm15574-201ENSMUST00000119937 405 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm12089-201ENSMUST00000138402 428 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm17188-202ENSMUST00000165178 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Aste1-204ENSMUST00000167674 1227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm17235-201ENSMUST00000169128 964 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm2974-202ENSMUST00000180184 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 4933406F09Rik-202ENSMUST00000180508 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 1700025H01Rik-201ENSMUST00000187479 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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