Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Trim12aQ99PQ1 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Trim12aQ99PQ1 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Trim12aQ99PQ1 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Trim12aQ99PQ1 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Trim12aQ99PQ1 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Trim12aQ99PQ1 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Trim12aQ99PQ1 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Trim12aQ99PQ1 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Trim12aQ99PQ1 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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Trim12aQ99PQ1 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Trim12aQ99PQ1 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Trim12aQ99PQ1 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Trim12aQ99PQ1 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Trim12aQ99PQ1 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Trim12aQ99PQ1 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim12aQ99PQ1 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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