Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Olfr1509-202ENSMUST00000205900 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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PtprtQ99M80 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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PtprtQ99M80 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
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PtprtQ99M80 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Fmn1-203ENSMUST00000102547 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Stat1-206ENSMUST00000186857 4241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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PtprtQ99M80 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprtQ99M80 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
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