Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms