Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Abca17-201ENSMUST00000039324 5202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Baz2a-202ENSMUST00000170054 8372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Baz2a-201ENSMUST00000045621 8369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Saal1-201ENSMUST00000143082 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Fam160a2-208ENSMUST00000179474 10853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 Gm37233-201ENSMUST00000192173 6263 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NischQ80TM9 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms