Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 4932415M13Rik-202ENSMUST00000184645 3063 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm38003-201ENSMUST00000191968 1504 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gtf2a1-201ENSMUST00000021345 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Nup210l-202ENSMUST00000200410 5710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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