Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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PcolceQ61398 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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PcolceQ61398 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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PcolceQ61398 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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PcolceQ61398 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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PcolceQ61398 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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PcolceQ61398 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PcolceQ61398 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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