Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm11209-201ENSMUST00000130206 431 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Defa-ps3-201ENSMUST00000142705 282 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm15179-202ENSMUST00000152799 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm8398-201ENSMUST00000172081 364 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm22871-201ENSMUST00000177097 54 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm5979-201ENSMUST00000193850 571 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm37841-201ENSMUST00000195367 376 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm6227-201ENSMUST00000205237 421 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm2734-201ENSMUST00000208561 743 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 AC156164.1-201ENSMUST00000216958 225 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 AC161424.1-201ENSMUST00000216969 666 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm32834-202ENSMUST00000222417 655 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Glycam1-201ENSMUST00000023134 628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Timm8b-201ENSMUST00000044051 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gdnf-201ENSMUST00000022744 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 AC117656.3-203ENSMUST00000225007 1809 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Ublcp1-201ENSMUST00000102795 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm43080-201ENSMUST00000199006 2643 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Pi4kb-203ENSMUST00000125476 3400 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Sprr2a2-201ENSMUST00000071805 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Klhl28-201ENSMUST00000021331 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Ceacam1-202ENSMUST00000098668 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Mad2l1-201ENSMUST00000101343 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Gm43154-206ENSMUST00000209562 1884 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Triml2-204ENSMUST00000210136 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Nip7-201ENSMUST00000034392 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Gm22471-201ENSMUST00000104116 130 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Znf48Q3US17 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms