Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms