Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms