Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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Rnf149Q3U2C5 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Rnf149Q3U2C5 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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