Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms