Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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