Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Ggta1P23336 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms