Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
P10404 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
P10404 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Trbv14-201ENSMUST00000103272 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm12838-201ENSMUST00000116278 325 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
P10404 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
P10404 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms