Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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Ccl20O89093 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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Ccl20O89093 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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Ccl20O89093 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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