Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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H2-Q1O19441 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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H2-Q1O19441 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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H2-Q1O19441 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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H2-Q1O19441 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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H2-Q1O19441 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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H2-Q1O19441 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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H2-Q1O19441 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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H2-Q1O19441 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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H2-Q1O19441 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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H2-Q1O19441 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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H2-Q1O19441 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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H2-Q1O19441 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-Q1O19441 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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