Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IfnabL7MTU6 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.4 ms