Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm34418-201ENSMUST00000212879 309 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm16391-201ENSMUST00000086601 447 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 Serpina1d-201ENSMUST00000078869 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rabgef1Q9JM13 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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