Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Stil-201ENSMUST00000030490 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
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Col5a3Q9JLI2 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Col5a3Q9JLI2 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Col5a3Q9JLI2 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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