Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

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Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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SacsQ9JLC8 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Abca8a-201ENSMUST00000046223 5614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SacsQ9JLC8 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SacsQ9JLC8 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SacsQ9JLC8 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SacsQ9JLC8 Umodl1-201ENSMUST00000066554 5007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SacsQ9JLC8 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SacsQ9JLC8 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SacsQ9JLC8 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SacsQ9JLC8 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SacsQ9JLC8 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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SacsQ9JLC8 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SacsQ9JLC8 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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