Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm13218-201ENSMUST00000128180 265 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm14242-201ENSMUST00000145204 375 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm26070-201ENSMUST00000157500 137 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm43069-201ENSMUST00000201006 859 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm44306-201ENSMUST00000203058 203 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 9230104L09Rik-201ENSMUST00000028937 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Mtbp-205ENSMUST00000170046 3197 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Trim39Q9ESN2 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Ankrd45-202ENSMUST00000111608 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm23192-201ENSMUST00000102434 96 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Mir467f-201ENSMUST00000116923 120 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm15941-204ENSMUST00000135401 726 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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