Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Tenm4-202ENSMUST00000107165 10930 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Pcdhb11-201ENSMUST00000053073 4419 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Setd1bQ8CFT2 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms