Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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Atg4aQ8C9S8 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Atg4aQ8C9S8 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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