Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC156025.3-201ENSMUST00000225919 3095 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Polq-201ENSMUST00000054034 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Pde6h-202ENSMUST00000137768 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm44902-201ENSMUST00000206177 805 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC153955.4-201ENSMUST00000217069 2752 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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