Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap25-203ENSMUST00000113637 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Tmcc3-202ENSMUST00000117460 3217 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gmfb-202ENSMUST00000111817 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gmfb-201ENSMUST00000079314 4171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Myo1g-201ENSMUST00000003459 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Kdelc1-202ENSMUST00000065767 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr61-202ENSMUST00000118771 3372 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 AC160405.2-201ENSMUST00000219008 1987 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Arpp19-209ENSMUST00000169492 3963 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Usp17lb-202ENSMUST00000106814 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Trcg1-201ENSMUST00000093837 2701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Oacyl-202ENSMUST00000117694 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Ube4bos1-201ENSMUST00000141259 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Fam149b-210ENSMUST00000224721 4483 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7933-201ENSMUST00000191215 2255 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 4930442J19Rik-202ENSMUST00000157058 1721 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 A530064D06Rik-201ENSMUST00000027764 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Rps6ka1-206ENSMUST00000168974 2982 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 4930509G22Rik-201ENSMUST00000181206 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Samd3-201ENSMUST00000060716 1874 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm525-201ENSMUST00000100619 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv14-2-201ENSMUST00000103467 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12046-201ENSMUST00000118536 331 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11220-201ENSMUST00000118844 475 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 H3f3a-ps2-201ENSMUST00000119544 411 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17136-201ENSMUST00000169993 411 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6931-202ENSMUST00000183137 1009 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6a-202ENSMUST00000186526 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 1700022H16Rik-201ENSMUST00000188935 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35067-201ENSMUST00000194355 647 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45436-201ENSMUST00000210729 469 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 AI463170-201ENSMUST00000217839 970 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 AC159282.1-206ENSMUST00000219268 708 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 AC139758.2-201ENSMUST00000228380 529 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Pigr-201ENSMUST00000027675 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Cd300e-201ENSMUST00000062787 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Tnf-202ENSMUST00000167924 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Slc14a1-202ENSMUST00000160292 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Myom1-201ENSMUST00000024847 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37110-201ENSMUST00000192993 1628 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44183-201ENSMUST00000203964 1628 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Col15a1-204ENSMUST00000107731 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Washc4-201ENSMUST00000038388 5858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Mef2c-218ENSMUST00000198199 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Bag3-201ENSMUST00000033136 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 4933412E24Rik-201ENSMUST00000096421 1748 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Smok2a-201ENSMUST00000080647 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Fyb-201ENSMUST00000090461 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc80-201ENSMUST00000061050 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Fancl-201ENSMUST00000004120 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms