Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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