Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm29144-201ENSMUST00000189235 339 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm29238-201ENSMUST00000189709 695 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Saal1-201ENSMUST00000143082 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Dennd6a-205ENSMUST00000224378 2424 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Arhgap19-202ENSMUST00000163265 5058 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Kalrn-204ENSMUST00000114949 3618 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 1700027J07Rik-203ENSMUST00000217501 1884 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Arhgap17-204ENSMUST00000205262 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Csf3r-202ENSMUST00000106162 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Olfr984-201ENSMUST00000056795 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Map4k4-209ENSMUST00000192509 3918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 CT009515.4-201ENSMUST00000228165 1494 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Nedd4-209ENSMUST00000184450 3329 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 AC138284.3-201ENSMUST00000217345 4663 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Supt7l-204ENSMUST00000201769 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms