Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rrp1P56183 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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