Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Kif26b-202ENSMUST00000161017 13749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Mbnl1-218ENSMUST00000194069 5460 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cux1P53564 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cux1P53564 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cux1P53564 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cux1P53564 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cux1P53564 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cux1P53564 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cux1P53564 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cux1P53564 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cux1P53564 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cux1P53564 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cux1P53564 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cux1P53564 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cux1P53564 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cux1P53564 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cux1P53564 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cux1P53564 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cux1P53564 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cux1P53564 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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