Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Myo5c-201ENSMUST00000036555 6727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprkP35822 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Zkscan1-203ENSMUST00000110962 4843 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprkP35822 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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