Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
P18530 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
P18530 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
P18530 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
P18530 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
P18530 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
P18530 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
P18530 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
P18530 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
P18530 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
P18530 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
P18530 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
P18530 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
P18530 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
P18530 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms