Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Map3k13-201ENSMUST00000042065 6709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 AC113031.6-202ENSMUST00000228468 1145 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sptan1P16546 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms