Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
XntrpcF8VQM8 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms