Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rrn3B2RS91 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms