Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms