Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 1500004A13Rik-202ENSMUST00000183707 6054 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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Col5a3Q9JLI2 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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Col5a3Q9JLI2 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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Col5a3Q9JLI2 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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Col5a3Q9JLI2 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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Col5a3Q9JLI2 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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Col5a3Q9JLI2 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Col5a3Q9JLI2 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Col5a3Q9JLI2 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Col5a3Q9JLI2 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Col5a3Q9JLI2 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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