Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Olfr650-ps1-201ENSMUST00000121432 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm5681-201ENSMUST00000189217 1533 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Trim39Q9ESN2 Gm25761-201ENSMUST00000103983 128 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Trim39Q9ESN2 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm11722-201ENSMUST00000138702 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm12861-201ENSMUST00000145395 681 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm24063-201ENSMUST00000157491 105 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm5350-201ENSMUST00000182057 1002 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Trim39Q9ESN2 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm28677-202ENSMUST00000186904 615 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 4933439J24Rik-201ENSMUST00000200866 853 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Nxpe1-ps-202ENSMUST00000210160 956 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Trim39Q9ESN2 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm21941-201ENSMUST00000221121 562 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Hsd17b3-204ENSMUST00000222783 1184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Trim39Q9ESN2 AC154249.1-201ENSMUST00000226296 320 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 CT009556.2-201ENSMUST00000227980 1123 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Timm8b-201ENSMUST00000044051 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Trim39Q9ESN2 Rab25-201ENSMUST00000008745 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Trim39Q9ESN2 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Tbc1d15-201ENSMUST00000020339 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm12378-201ENSMUST00000116171 1461 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Trim39Q9ESN2 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Eif4a2-202ENSMUST00000077605 2708 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Spef2-205ENSMUST00000162780 1639 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr353-201ENSMUST00000100149 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm15220-201ENSMUST00000120730 379 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm4908-201ENSMUST00000121923 1005 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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