Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms