Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn23Q9D7D7 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms