Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

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Length 1,985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Tbc1d24-207ENSMUST00000171189 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm3138-201ENSMUST00000165431 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Hipk1-203ENSMUST00000118317 7939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Nucb1-210ENSMUST00000211765 4853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Setd1bQ8CFT2 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Zfyve16-201ENSMUST00000022217 6150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Katnal1-201ENSMUST00000047257 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Setd1bQ8CFT2 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms