Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm37185-201ENSMUST00000193852 410 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm6819-201ENSMUST00000185325 1891 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm8802-201ENSMUST00000118633 740 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm15857-201ENSMUST00000133476 789 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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